目前，国外已经有十多家从事DNA 芯片研究的公司，他们的芯片技术虽然各具特色，应用目的也不尽相同。但要成为实验室研究或可以普遍采用的技术仍有一些关键问题亟待解决

（1）提高基因芯片的特异性；

（2）简化样品制备和标记操作；

（3）增加信号检测的灵敏度；

（4）高度集成化样品制备、基因扩增、核酸标记及检测仪器的研制和开发。

  上述问题不仅是当前和今后一段时期内国内外基因芯片技术研究的焦点，同时也是基因芯片能否从实验室研究推向应用的关键问题。总之，基因芯片技术发展到今天不过短短几年时间，虽然还存在这样或那样的问题，但其在基因表达谱分析、基因诊断、药物筛选及序列分析等诸多领域已呈现出广阔的应用前景，随着研究的不断深入和技术的更加完善基因芯片一定会在生命科学研究领域发挥出其非凡的作用。 从某种意义上我们可以这样认为：基因的结构或种类决定物种；基因的功能或表达则决定生命，即生物的生、老、病、死。基因芯片技术将为
我们提供一条认识生命本质的捷径。

    只要事先除去高度及中等重复序列，任何DNA 都可以被用于Microarray。zui简单的例子是用机械手把极微量（nanoliters）的DNA 点到玻片或其它载体上，照射UV light 使之*固定，用不同细胞周期发育阶段的cDNA 作探针系统性地研究细胞中任意时期特异表达的基因；若把某一生物体内全部全部已知基因分别点到DNA 微列阵或者基因芯片上，再用不同发育阶段的cDNA 与之杂交，就能了解某些基因对特定生长发育阶段的重要性；基因芯片还可用于进行基因诊断，可建立正常人特定组织、器官的基因芯片，给出标准杂交信号图。用可疑病人的cDNA 做探针与之杂交，检查哪些基因的表达受抑制或激活。